Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LBPP18428 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LBPP18428 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LBPP18428 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LBPP18428 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LBPP18428 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LBPP18428 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LBPP18428 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LBPP18428 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LBPP18428 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LBPP18428 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LBPP18428 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms