Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTN1P12814 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms