Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms