Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA1C9JL84 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms