Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRRT4C9JH25 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRRT4C9JH25 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms