Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
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