Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RIMS3Q9UJD0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms