Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPG2Q9UBF2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms