Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00474Q9P2X8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms