Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CC2D2AQ9P2K1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms