Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms