Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTLNQ9NXG0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms