Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG3Q9NT62 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms