Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms