Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms