Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms