Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms