Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC42Q96M95 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC42Q96M95 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms