Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms