Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCTD13Q8WZ19 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCTD13Q8WZ19 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms