Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms