Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP9Q5VTM2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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