Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms