Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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