Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms