Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
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