Protein–RNA interactions for Protein: Q13976

PRKG1, cGMP-dependent protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKG1Q13976 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKG1Q13976 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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