Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF5Q13568 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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