Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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GPS1Q13098 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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GPS1Q13098 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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