Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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