Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms