Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms