Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms