Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP2C1P98194 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms