Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTRA4P83105 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTRA4P83105 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTRA4P83105 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTRA4P83105 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTRA4P83105 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTRA4P83105 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTRA4P83105 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTRA4P83105 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTRA4P83105 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTRA4P83105 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTRA4P83105 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTRA4P83105 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms