Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms