Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERVPABLB-1P60509 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms