Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms