Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AP001198.2-201ENST00000593121 466 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSEN1P49768 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms