Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLCP48506 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCLCP48506 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCLCP48506 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCLCP48506 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCLCP48506 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCLCP48506 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLCP48506 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms