Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms