Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms