Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT3P12035 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT3P12035 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KRT3P12035 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KRT3P12035 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KRT3P12035 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KRT3P12035 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KRT3P12035 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KRT3P12035 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT3P12035 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT3P12035 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT3P12035 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT3P12035 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT3P12035 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT3P12035 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT3P12035 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT3P12035 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT3P12035 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT3P12035 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT3P12035 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms