Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ESRRAP11474 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms