Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms