Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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PKHD1P08F94 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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