Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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