Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms