Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
USP17L12C9JPN9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2458.9 ms