Protein–RNA interactions for Protein: C9J1S8

TRIM49D1, Tripartite motif-containing protein 49D, humanhuman

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Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49D1C9J1S8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM49D1C9J1S8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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